Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp5Q9Z2P8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms