Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms