Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd2Q9Z2E1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms