Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mtmr1Q9Z2C4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr1Q9Z2C4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms