Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn8Q9Z260 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms