Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs4Q9Z1T2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs4Q9Z1T2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Thbs4Q9Z1T2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs4Q9Z1T2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs4Q9Z1T2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs4Q9Z1T2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs4Q9Z1T2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs4Q9Z1T2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms