Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ap3b1Q9Z1T1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms