Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lgr5Q9Z1P4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgr5Q9Z1P4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms