Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms