Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Supt4h1bQ9Z199 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms