Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmg20bQ9Z104 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms