Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf15Q9Z0J7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf15Q9Z0J7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms