Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gipc1Q9Z0G0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gipc1Q9Z0G0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms