Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pmfbp1Q9WVQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms