Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp46a1Q9WVK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms