Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stxbp4Q9WV89 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp4Q9WV89 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms