Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mixl1Q9WUI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms