Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp1Q9WTX5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp1Q9WTX5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms