Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkraQ9WTX2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms