Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TapbpQ9R233 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms