Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb2Q9R1P3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb2Q9R1P3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb2Q9R1P3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb2Q9R1P3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms