Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit2Q9R1B9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slit2Q9R1B9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms