Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ripk3Q9QZL0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk3Q9QZL0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms