Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a3Q9QZB6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a3Q9QZB6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a3Q9QZB6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a3Q9QZB6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a3Q9QZB6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms