Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vnn3Q9QZ25 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms