Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb11Q9QY30 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb11Q9QY30 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb11Q9QY30 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms