Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Limd1Q9QXD8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms