Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc5Q9QX29 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc5Q9QX29 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms