Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyth1Q9QX11 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms