Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms