Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PolkQ9QUG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolkQ9QUG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolkQ9QUG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms