Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub1Q9JMG3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmub1Q9JMG3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmub1Q9JMG3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms