Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms