Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arl6ip1Q9JKW0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms