Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stx6Q9JKK1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms