Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp39a1Q9JKJ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms