Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ap4m1Q9JKC7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap4m1Q9JKC7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms