Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra4Q9JJT2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gfra4Q9JJT2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra4Q9JJT2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms