Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6l2Q9JIM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms