Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup50Q9JIH2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup50Q9JIH2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup50Q9JIH2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup50Q9JIH2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup50Q9JIH2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup50Q9JIH2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup50Q9JIH2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms