Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cmtm7Q9ESD6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm7Q9ESD6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms