Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfip11Q9ERA6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfip11Q9ERA6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms