Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndst4Q9EQW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms