Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Ndst3Q9EQH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Ndst3Q9EQH7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Ndst3Q9EQH7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Ndst3Q9EQH7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Ndst3Q9EQH7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Ndst3Q9EQH7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndst3Q9EQH7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms