Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r63Q9EPT1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms