Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a1Q9EPE9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a1Q9EPE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms