Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Rbp7Q9EPC5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Rbp7Q9EPC5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Rbp7Q9EPC5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Rbp7Q9EPC5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Rbp7Q9EPC5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbp7Q9EPC5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Rbp7Q9EPC5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Rbp7Q9EPC5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Rbp7Q9EPC5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Rbp7Q9EPC5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Rbp7Q9EPC5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Rbp7Q9EPC5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbp7Q9EPC5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbp7Q9EPC5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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