Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms