Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GabarapQ9DCD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms