Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne8Q9DC53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne8Q9DC53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms